276:
135:
1185:
293:
287:
703:
930:
261:
496:
389:
1031:
177:
1142:
752:
979:
940:
646:
237:
838:
621:
491:
217:
197:
1115:
989:
779:
454:
528:
449:
1205:
466:
332:
117:
114:
111:
108:
105:
102:
99:
96:
93:
90:
87:
84:
81:
78:
75:
72:
69:
66:
63:
60:
57:
54:
51:
48:
45:
42:
37:
1093:
920:
740:
1200:
1088:
1016:
384:
153:
444:
984:
8:
1110:
935:
369:
1041:
1036:
651:
1137:
1051:
826:
774:
379:
258:
1159:
1132:
895:
875:
572:
23:
720:
364:
241:
221:
181:
201:
1056:
925:
915:
656:
347:
265:
174:
17:
157:
1194:
880:
626:
481:
476:
994:
945:
32:
1171:
853:
725:
681:
641:
636:
409:
1127:
1105:
804:
784:
604:
587:
534:
352:
1021:
900:
858:
843:
794:
789:
769:
730:
555:
545:
511:
424:
322:
1078:
1011:
885:
870:
698:
631:
609:
550:
506:
471:
439:
399:
317:
1083:
1073:
1061:
1026:
1006:
967:
910:
821:
735:
686:
671:
666:
582:
434:
429:
414:
404:
394:
374:
342:
305:
286:
The following 144 pages are in this category, out of 145 total.
150:
132:
This category has the following 6 subcategories, out of 7 total.
1154:
848:
809:
799:
676:
661:
599:
567:
540:
501:
419:
16:
This category contains articles about software that is used in
1176:
1046:
962:
950:
905:
890:
757:
708:
523:
337:
577:
486:
327:
1192:
704:High-performance Integrated Virtual Environment
25:
931:Protein subcellular localization prediction
283:Pages in category "Bioinformatics software"
497:Computational Resource for Drug Discovery
390:Bioinformatics workflow management system
288:This list may not reflect recent changes
1193:
1032:Short Oligonucleotide Analysis Package
1143:Viral Bioinformatics Resource Center
127:
13:
297:
262:Structural bioinformatics software
139:
126:
14:
1217:
753:Kepler scientific workflow system
980:Recombination detection program
941:Proteomics Standards Initiative
647:Generic Model Organism Database
839:OLIGO Primer Analysis Software
622:Galaxy (computational biology)
492:COMPLEAT (Bioinformatics tool)
1:
1116:UTOPIA (bioinformatics tools)
990:Rosalind (education platform)
780:Mass spectrometry data format
455:Budapest Reference Connectome
281:
178:Free bioinformatics software
7:
529:De novo sequence assemblers
10:
1222:
450:Bowtie (sequence analysis)
467:Chemistry Development Kit
333:Anduril (workflow engine)
1094:Trans-Proteomic Pipeline
921:PLINK (genetic tool-set)
741:Intrinsic Noise Analyzer
1089:TopHat (bioinformatics)
1017:Sequence profiling tool
385:Bioinformatic Harvester
238:Phylogenetics software
445:BLAT (bioinformatics)
218:Neuroimaging software
198:Metagenomics software
985:RNA integrity number
1111:UCSC Genome Browser
936:The Proteolysis Map
370:Bellerophon program
1042:Snagger (software)
1037:Skyline (software)
652:GENESIS (software)
1138:ViennaRNA Package
1052:SPAdes (software)
827:Nvidia Parabricks
775:Mascot (software)
380:BioCompute Object
1213:
1206:Science software
1160:WHAT IF software
1133:Velvet assembler
896:Phred (software)
876:Pathway analysis
573:Empire (program)
537:
267:
260:
243:
223:
203:
183:
176:
159:
152:
1221:
1220:
1216:
1215:
1214:
1212:
1211:
1210:
1191:
1190:
1189:
1183:
1182:
1181:
1164:
1147:
1120:
1098:
1066:
999:
972:
955:
863:
831:
814:
762:
745:
721:IMOD (software)
713:
691:
614:
592:
560:
533:
516:
459:
365:Beacon designer
357:
310:
280:
274:
273:
272:
269:
268:
257:
248:
245:
244:
228:
225:
224:
208:
205:
204:
188:
185:
184:
173:
164:
161:
160:
149:
125:
124:
123:
122:
28:
12:
11:
5:
1219:
1209:
1208:
1203:
1201:Bioinformatics
1188:) (next page)
1180:
1179:
1174:
1168:
1165:
1163:
1162:
1157:
1151:
1148:
1146:
1145:
1140:
1135:
1130:
1124:
1121:
1119:
1118:
1113:
1108:
1102:
1099:
1097:
1096:
1091:
1086:
1081:
1076:
1070:
1067:
1065:
1064:
1059:
1057:Staden Package
1054:
1049:
1044:
1039:
1034:
1029:
1024:
1019:
1014:
1009:
1003:
1000:
998:
997:
992:
987:
982:
976:
973:
971:
970:
965:
959:
956:
954:
953:
948:
943:
938:
933:
928:
926:Primer Premier
923:
918:
916:Pipeline Pilot
913:
908:
903:
898:
893:
888:
883:
878:
873:
867:
864:
862:
861:
856:
851:
846:
841:
835:
832:
830:
829:
824:
818:
815:
813:
812:
807:
802:
797:
792:
787:
782:
777:
772:
766:
763:
761:
760:
755:
749:
746:
744:
743:
738:
733:
728:
723:
717:
714:
712:
711:
706:
701:
695:
692:
690:
689:
684:
679:
674:
669:
664:
659:
657:Genevestigator
654:
649:
644:
639:
634:
629:
624:
618:
615:
613:
612:
607:
602:
596:
593:
591:
590:
585:
580:
575:
570:
564:
561:
559:
558:
553:
548:
543:
538:
531:
526:
520:
517:
515:
514:
509:
504:
499:
494:
489:
484:
479:
474:
469:
463:
460:
458:
457:
452:
447:
442:
437:
432:
427:
422:
417:
412:
407:
402:
397:
392:
387:
382:
377:
372:
367:
361:
358:
356:
355:
350:
348:Apache Taverna
345:
340:
335:
330:
325:
320:
314:
311:
309:
308:
302:
299:
298:
284:
279:) (next page)
271:
270:
256:
255:
252:
249:
247:
246:
236:
235:
232:
229:
227:
226:
216:
215:
212:
209:
207:
206:
196:
195:
192:
189:
187:
186:
172:
171:
168:
165:
163:
162:
154:DICOM software
148:
147:
144:
141:
140:
130:
121:
120:
40:
35:
29:
27:
24:
22:
18:bioinformatics
9:
6:
4:
3:
2:
1218:
1207:
1204:
1202:
1199:
1198:
1196:
1187:
1186:previous page
1178:
1175:
1173:
1170:
1169:
1166:
1161:
1158:
1156:
1153:
1152:
1149:
1144:
1141:
1139:
1136:
1134:
1131:
1129:
1126:
1125:
1122:
1117:
1114:
1112:
1109:
1107:
1104:
1103:
1100:
1095:
1092:
1090:
1087:
1085:
1082:
1080:
1077:
1075:
1072:
1071:
1068:
1063:
1060:
1058:
1055:
1053:
1050:
1048:
1045:
1043:
1040:
1038:
1035:
1033:
1030:
1028:
1025:
1023:
1020:
1018:
1015:
1013:
1010:
1008:
1005:
1004:
1001:
996:
993:
991:
988:
986:
983:
981:
978:
977:
974:
969:
966:
964:
961:
960:
957:
952:
949:
947:
944:
942:
939:
937:
934:
932:
929:
927:
924:
922:
919:
917:
914:
912:
909:
907:
904:
902:
899:
897:
894:
892:
889:
887:
884:
882:
881:PatternHunter
879:
877:
874:
872:
869:
868:
865:
860:
857:
855:
852:
850:
847:
845:
842:
840:
837:
836:
833:
828:
825:
823:
820:
819:
816:
811:
808:
806:
803:
801:
798:
796:
793:
791:
788:
786:
783:
781:
778:
776:
773:
771:
768:
767:
764:
759:
756:
754:
751:
750:
747:
742:
739:
737:
734:
732:
729:
727:
724:
722:
719:
718:
715:
710:
707:
705:
702:
700:
697:
696:
693:
688:
685:
683:
680:
678:
675:
673:
670:
668:
665:
663:
660:
658:
655:
653:
650:
648:
645:
643:
640:
638:
635:
633:
630:
628:
627:Gene Designer
625:
623:
620:
619:
616:
611:
608:
606:
603:
601:
598:
597:
594:
589:
586:
584:
581:
579:
576:
574:
571:
569:
566:
565:
562:
557:
554:
552:
549:
547:
544:
542:
539:
536:
532:
530:
527:
525:
522:
521:
518:
513:
510:
508:
505:
503:
500:
498:
495:
493:
490:
488:
485:
483:
482:CloudBioLinux
480:
478:
477:Clone manager
475:
473:
470:
468:
465:
464:
461:
456:
453:
451:
448:
446:
443:
441:
438:
436:
433:
431:
428:
426:
423:
421:
418:
416:
413:
411:
408:
406:
403:
401:
398:
396:
393:
391:
388:
386:
383:
381:
378:
376:
373:
371:
368:
366:
363:
362:
359:
354:
351:
349:
346:
344:
341:
339:
336:
334:
331:
329:
326:
324:
321:
319:
316:
315:
312:
307:
304:
303:
300:
296:) (next page)
295:
294:previous page
291:
289:
282:
278:
277:previous page
263:
259:
254:
253:
250:
239:
234:
233:
230:
219:
214:
213:
210:
199:
194:
193:
190:
179:
175:
170:
169:
166:
155:
151:
146:
145:
142:
138:) (next page)
137:
136:previous page
133:
129:Subcategories
128:
119:
116:
113:
110:
107:
104:
101:
98:
95:
92:
89:
86:
83:
80:
77:
74:
71:
68:
65:
62:
59:
56:
53:
50:
47:
44:
41:
39:
36:
34:
31:
30:
21:
19:
995:Rosetta@home
946:ProteoWizard
285:
131:
15:
1172:XCMS Online
854:OrthoFinder
726:Integromics
682:Geworkbench
642:GenePattern
637:GeneNetwork
410:BioNumerics
266:(1 C, 15 P)
182:(2 C, 33 P)
1195:Categories
1128:Vector NTI
1106:Ubuntu-Med
805:Morphobank
785:MEME suite
605:FlyExpress
588:Eurocarbdb
535:Debian-Med
353:ArrayTrack
158:(1 C, 6 P)
1022:Sequerome
901:Phyloscan
859:Osteoware
844:OpenChrom
795:MochiView
790:Metascape
770:MacVector
731:InterMine
556:DTA GView
546:DNADynamo
512:Cytoscape
425:Biopython
323:AlphaFold
26:Contents
1079:TimeTree
1012:SAMtools
886:PhagesDB
871:ParaSurf
699:HH-suite
632:GeneMark
610:Formatdb
551:DreamLab
507:CS-BLAST
472:CheShift
440:Blast2GO
400:BioLinux
318:AlleleID
1084:TopFIND
1074:TaveRNA
1062:Stemloc
1027:Sequest
1007:SAAM II
968:Qlucore
911:PICRUSt
822:Newbler
736:IntFOLD
687:GLIMMER
672:GENSCAN
667:GenMAPP
583:ETBLAST
435:BioSLAX
430:BioRuby
415:BioPerl
405:BioMart
395:BioJava
375:BioBIKE
343:ANNOVAR
306:3D-Jury
1155:Webtag
849:OpenMS
810:MUMmer
800:MolIDE
677:GENtle
662:GenGIS
600:FlowJo
568:EMBOSS
541:DESeq2
502:Consed
420:BioPHP
242:(35 P)
222:(23 P)
1177:Xrate
1047:SOSUI
963:QIIME
951:PSORT
906:Phyre
891:Phrap
758:KiSAO
709:HMMER
524:DAVID
338:ANGIS
202:(9 P)
578:EsyN
487:Cn3D
328:AMAP
301:0–9
38:0–9
33:Top
1197::
290:.
264:
240:
220:
200:
180:
156:
20:.
1184:(
1167:X
1150:W
1123:V
1101:U
1069:T
1002:S
975:R
958:Q
866:P
834:O
817:N
765:M
748:K
716:I
694:H
617:G
595:F
563:E
519:D
462:C
360:B
313:A
292:(
275:(
251:S
231:P
211:N
191:M
167:F
143:D
134:(
118:Z
115:Y
112:X
109:W
106:V
103:U
100:T
97:S
94:R
91:Q
88:P
85:O
82:N
79:M
76:L
73:K
70:J
67:I
64:H
61:G
58:F
55:E
52:D
49:C
46:B
43:A
Text is available under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License. Additional terms may apply.