4470:
57:
31:
3368:
3467:(within the Bacillota phylum) was the most common. When the microbiota of obese mice with this higher Bacillota abundance was transplanted into the guts of germ-free mice, the germ-free mice gained a significant amount of fat as compared to those transplanted with the microbiota of lean mice with lower Bacillota abundance.
3462:
Diet changes in mice have also been shown to promote changes in
Bacillota abundance. A higher relative abundance of Bacillota was seen in mice fed a western diet (high fat/high sugar) than in mice fed a standard low fat/ high polysaccharide diet. The higher amount of Bacillota was also linked to more
302:
The name "Firmicutes" was derived from the Latin words for "tough skin," referring to the thick cell wall typical of bacteria in this phylum. Scientists once classified the
Firmicutes to include all gram-positive bacteria, but have recently defined them to be of a core group of related forms called
4418:
Goodrich, Julia K.; Waters, Jillian L.; Poole, Angela C.; Sutter, Jessica L.; Koren, Omry; Blekhman, Ran; Beaumont, Michelle; Van
Treuren, William; Knight, Rob; Bell, Jordana T.; Spector, Timothy D.; Clark, Andrew G.; Ley, Ruth E. (2014).
436:, by models there the archaea branched relatively late from bacteria, rather than forming an independently originating early lineage (domain of life) from the last universal common ancestor of cellular life (LUCA).
4147:
3565:
299:
structure. The renaming of phyla such as
Firmicutes in 2021 remains controversial among microbiologists, many of whom continue to use the earlier names of long standing in the literature.
3981:
3782:
3459:(of the Bacillota phylum) has been found in obese patients and in one study, obese patients put on weight loss diets showed a reduced amount of Bacillota within their guts.
3592:
3448:, which makes up 5% of the total gut microbiome, is a member of the Bacillota phylum. This species is directly associated with reduced low-grade inflammation in obesity.
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and can survive extreme conditions. They are found in various environments, and the group includes some notable pathogens. Those in one family, the
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4655:
3778:
3616:"Phylogeny of Firmicutes with special reference to Mycoplasma (Mollicutes) as inferred from phosphoglycerate kinase amino acid sequence data"
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5044:
4226:
Komaroff AL. The
Microbiome and Risk for Obesity and Diabetes. JAMA. Published online December 22, 2016. doi:10.1001/jama.2016.20099
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In multiple studies a higher abundance of
Bacillota has been found in obese individuals than in lean controls. A higher level of
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More than 274 genera were considered as of 2016 to be within the
Bacillota phylum, notable genera of Bacillota include:
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Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI (2006). "Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity".
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6618:
6599:
4546:
311:. They have round cells, called cocci (singular coccus), or rod-like forms (bacillus). A few Firmicutes, such as
409:. However, Bacillota as a whole is generally believed to be monophyletic, or paraphyletic with the exclusion of
3806:"The origin of a derived superkingdom: how a gram-positive bacterium crossed the desert to become an archaeon"
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4330:"Diet-Induced Obesity Is Linked to Marked but Reversible Alterations in the Mouse Distal Gut Microbiome"
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has been shown to be involved in energy resorption, and potentially related to the development of
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has been found in higher levels within the guts of obese children than in non-obese children.
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4037:"Ecological and evolutionary forces shaping microbial diversity in the human intestine"
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adiposity and body weight within mice. Specifically, within obese mice, the class
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Ley RE, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone CA, Knight RD, Gordon JI (August 2005).
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3441:. Within the gut of healthy human adults, the most abundant bacterium:
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8187:
4488:- J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
358:. Bacillota play an important role in beer, wine, and cider spoilage.
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3669:"Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life"
3434:
3251:
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477:
405:
289:
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8174:
3519:"Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes"
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335:, have a porous pseudo-outer membrane that causes them to stain
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7605:
4287:
Million, M.; Lagier, J.-C; Yahav, D.; Paul, M. (April 2013).
432:
The
Firmicutes are thought by some to be the source of the
7771:
7263:
4167:
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4417:
3613:
4521:
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3749:
List of
Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
423:
List of
Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
4286:
3476:(Bacillota, in class Clostridia), isolated from human
3614:
Wolf M, Müller T, Dandekar T, Pollack JD (May 2004).
262:
corrig. Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980)
3387:
and explaining the responses to the fringe theories.
4242:World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology
4034:
8290:
7548:Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms
4077:
4238:"New-found link between microbiota and obesity"
4236:Chakraborti, Chandra Kanti (15 November 2015).
4028:
7247:
6412:
4507:
3996:
3779:National Center for Biotechnology Information
3585:"Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar"
427:National Center for Biotechnology Information
421:The currently accepted taxonomy based on the
256:Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980)
4235:
3607:
3516:
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4514:
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29:
4452:
4421:"Human Genetics Shape the Gut Microbiome"
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3480:, has been found to correlate with lower
3413:Learn how and when to remove this message
238:(Cavalier-Smith 1998) Cavalier-Smith 2020
3742:
3582:
3425:Bacillota make up ~30% of the mouse and
3351:
366:The group is typically divided into the
7279:
6696:Cutaneous Streptococcus iniae infection
4376:
4035:Ley RE, Peterson DA, Gordon JI (2006).
3804:Ruben E Valas, Philip E Bourne (2011).
8291:
7507:
4379:"Gut bacterial microbiota and obesity"
4289:"Gut bacterial microbiota and obesity"
4170:"Obesity alters gut microbial ecology"
3429:. The phylum Bacillota as part of the
8026:
8025:
7235:
6400:
4495:
4328:Turnbaugh, Peter J. (17 April 2008).
4134:
3932:
8237:7a6efc07-44cd-475c-b911-bbb65c84d991
6830:Staphylococcal scalded skin syndrome
4016:from the original on 1 November 2021
3964:
3952:from the original on 26 October 2022
3361:
378:, which are obligate or facultative
342:Many Bacillota (Firmicutes) produce
4293:Clinical Microbiology and Infection
4135:Henig, Robin Marantz (2006-08-13).
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389:, the first two groups show up as
14:
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354:, produce energy through
346:, which are resistant to
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101:
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50:
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4009:Genome Taxonomy Database
3977:Genome Taxonomy Database
3945:Genome Taxonomy Database
3499:List of bacterial orders
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451:Genome Taxonomy Database
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3667:Ciccarelli, FD (2006).
3494:List of bacteria genera
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8258:Paleobiology Database
7704:Neocallimastigomycota
7182:Mycoplasma pneumoniae
7175:Mycoplasma genitalium
7014:Clostridium botulinum
6760:Enterococcus faecalis
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3622:(Comparative Study).
3352:Clinical significance
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4180:(31): 11070–11075.
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4092:(7122): 1022–1023.
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2564:"Halanaerobiaeota"
2171:" {Bacillota s.s.}
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198:Thermolithobacteria
169:Neupane et al. 2020
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125:Cavalier-Smith 2020
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4807:"Eudoremicrobiia"
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4142:The New York Times
4088:(Clinical Trial).
3383:appropriate weight
2989:Carboxydothermales
2941:" {GCA-003054495}
2882:Thermacetogeniales
2833:Desulfitobacteriia
1888:Desulfitobacteriia
1726:Desulfofundulaceae
1458:Thermodesulfobiota
926:Thermacetogeniales
909:Carboxydothermales
387:phylogenetic trees
177:Ludwig et al. 2010
153:Ludwig et al. 2010
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3381:, without giving
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7464:
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7457:
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7452:
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7350:
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6684:
6680:
6672:
6669:
6668:
6667:
6666:
6665:S. agalactiae
6661:
6657:
6656:
6654:
6652:
6648:
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6515:
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6362:Teskebacteria
6359:
6356:
6352:
6348:"Qinglongiia"
6347:
6346:
6344:
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6337:
6333:
6316:
6313:
6312:Magnetococcia
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6306:
6305:Mariprofundia
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5964:
5960:
5955:
5954:
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5843:
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5823:
5822:
5820:
5816:
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5808:
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5784:
5781:
5780:
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5776:
5771:
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5768:
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5763:
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5761:
5758:
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5752:
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5741:
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5702:
5698:
5695:
5691:
5686:
5685:
5683:
5679:
5674:
5673:
5672:
5671:Calditrichota
5669:
5665:
5662:
5659:
5656:
5653:
5649:
5647:
5644:
5642:
5639:
5638:
5637:
5634:
5633:
5631:
5627:
5623:
5614:
5612:
5611:Lentisphaeria
5609:
5606:
5605:
5604:
5601:
5596:
5594:
5591:
5589:
5588:Phycisphaeria
5586:
5583:
5582:
5581:
5578:
5574:
5571:
5570:
5569:
5566:
5565:
5563:
5559:
5555:
5546:
5542:
5540:"Leptospiria"
5539:
5537:"Exilispiria"
5536:
5533:
5530:
5529:
5528:
5527:Spirochaetota
5525:
5522:
5518:
5513:
5512:
5510:
5506:
5505:
5503:
5497:
5488:
5487:
5485:
5481:
5476:
5475:
5473:
5469:
5466:
5462:
5457:
5456:
5454:
5450:
5445:
5444:
5442:
5438:
5435:
5431:
5430:
5428:
5424:
5417:
5413:
5408:
5406:"Omnitrophia"
5405:
5404:
5402:
5398:
5395:
5391:
5388:
5384:
5380:Endomicrobiia
5379:
5376:
5375:
5374:
5371:
5368:
5364:
5359:
5356:
5353:
5350:
5349:
5347:
5346:Auribacterota
5343:
5338:
5337:
5335:
5331:
5330:
5328:
5324:
5321:
5319:
5315:
5314:Hydrobacteria
5311:
5304:
5300:
5295:
5294:
5292:
5288:
5283:
5282:
5280:
5276:
5271:
5270:
5268:
5264:
5260:Fusobacteriia
5259:
5258:
5257:
5254:
5253:
5251:
5249:Fusobacterida
5247:
5235:"Thermotogia"
5234:
5233:
5232:
5229:
5224:
5223:
5221:
5217:
5212:
5211:
5209:
5205:
5200:
5199:
5198:
5195:
5191:
5188:
5187:
5186:
5183:
5178:
5177:
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5175:Caldisericota
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4043:(Review).
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3505:References
3465:Mollicutes
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3356:See also:
3305:Clostridia
3237:Bacillales
2135:Mollicutes
1625:Firmicutes
411:Mollicutes
374:, and the
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4557:Eukaryota
4445:0092-8674
4122:205034045
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3689:CiteSeerX
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